How big is Sigade tsirkoviirus?

Sigade tsirkoviirus on sigu nakatav viirus ja 2026. aasta seisuga üks väikseimaid teadaolevaid viirusi. Selle osakesed on umbes 17 nanomeetri läbimõõduga ja nanomeeter on meetri miljardik. See laius on viiruse DNA-d hoidva pisikese valgukera läbimõõt.

Suurus

Iga osake on valgukest, mida nimetatakse kapsiidiks ja millel pole välist ümbrist. Kapsiid on ehitatud 60 koopiast ühest ja samast valgust ning need on rühmitatud 12 viiest koopiast koosnevaks rühmaks. See paigutus annab sellele ikosaeedri sümmeetria; ikosaeeder on kuju, millel on 20 kolmnurkset tahku. Kest on umbes 2,5 nanomeetrit paks.

Avaldatud mõõtmised ulatuvad umbes 15-st 25 nanomeetrini. 2019. aastal mõõtsid viirust puhastanud teadlased elektronmikroskoobi piltidel umbes 17 nanomeetri läbimõõduga osakesi. 2003. aasta uuringus ehitati külmutatud osakeste piltidest kolmemõõtmeline mudel ja mõõdeti umbes 20,5 nanomeetrit, ulatudes veidi kõrgemale tõusvate valgurühmade tippudeni. Rahvusvaheline Viiruste Taksonoomia Komitee (ICTV) annab sigade tsirkoviirustele ja ühele papagoide sugulasviirusele 15–25 nanomeetrit.

Suuruste võrdlused

B-hepatiidi viirus, mille läbimõõt on umbes 42 nanomeetrit, on umbes 2,5 korda laiem kui sigade tsirkoviirus ja ruumalalt umbes 15 korda suurem.
Sigade tsirkoviirus on umbes kolm ja pool korda nii lai, kui rakumembraani fosfolipiidne kaksikkiht on paks, ja umbes 8,5 korda nii lai kui 2 nanomeetri laiune DNA kaksikheeliks.
Umbes 5 000 sigade tsirkoviirust, kõrvuti asetatud, ulatuksid inimese juuksekarva laiuseni, milleks on 80 000–100 000 nanomeetrit.
Kui sigade tsirkoviirus oleks suurendatud 1,7 meetri pikkuse inimese kasvuks, oleks inimese juuksekarv 8–10 kilomeetrit lai.

DNA ja nimi

Kapsiidi sees on üks ainult ühe ahelaga DNA ring, mis on PCV1-ks nimetatud tüübis 1 759 aluse ja PCV2-s 1 768 aluse pikkune. Ringikujuline DNA annab viirusele nime: „circo“ pärineb ingliskeelsest sõnast „circular“ (ringikujuline).

DNA-s on kaks peamist geeni. Üks toodab valku, mida on vaja DNA kopeerimise alustamiseks, ja teine kapsiidivalku. 2026. aasta seisuga kirjeldab ICTV PCV1 ja PCV2 genoome kui väikseimaid kõigist viirustest, mille kohta on näidatud, et need paljunevad imetajarakkudes iseseisvalt.

Haigus sigadel

Looduslikud nakkused näivad piirduvat sigadega, sealhulgas metssigadega, ja viirus levib enamasti siis, kui sead neelavad nakatunud väljaheite jälgi. PCV1 pole seostatud ühegi haigusega. PCV2 on üks peamisi põhjusi, miks 8–16 nädala vanustel põrsastel tekib kõhnestushaigus, millega kaasnevad kaalulangus, hingamisraskused, kollatõbi, paistes lümfisõlmed ja kõhulahtisus. Haigust saab kontrolli all hoida sigade vaktsineerimisega.

Osakesi on raske hävitada. PCV1 talub pH 3 happelist keskkonda, kuumutamist 70 °C-ni 15 minuti jooksul ja lahusteid, näiteks kloroformi.