نواة الكلور هي مركز ذرة الكلور. تضم 17 بروتونًا، و18 أو 20 نيوترونًا في النوعين اللذين يتكوّن منهما الكلور الطبيعي. ويبلغ قطر نواة النوع الأكثر شيوعًا، وهو الكلور-35، نحو 6.7 فمتومتر، ويُحسب بوصفه ضعف نصف قطر شحنتها. والفمتومتر جزء من مليون من جزء من مليار من المتر (10−15 متر).
ليس للنواة حافة صلبة، لذا يُعطى حجمها على صورة نصف قطر الشحنة، أي متوسط نصف قطر شحنتها الكهربائية. وبالنسبة إلى الكلور-35، يعطي جدول لأنصاف أقطار النوى تعدّه الوكالة الدولية للطاقة الذرية (IAEA) القيمة 3.365 فمتومتر. وأفاد قياس أدق عام 2026، استُخدمت فيه ذرات يحل فيها جسيم أثقل يسمى الميون محل الإلكترون، بالقيمة 3.333 فمتومتر. وبكلتا القيمتين يبلغ قطر النواة نحو 6.7 فمتومتر.
تسمى ذرات العنصر نفسه التي يختلف عدد نيوتروناتها النظائر. ويزيد الكلور-37 على الكلور-35 بنيوترونين، لكن نواته لا تزيد عرضًا إلا بأقل من 1%. ونحو ثلاثة أرباع الكلور على الأرض هو الكلور-35.
وكمعظم النوى التي تضم أكثر من 15 بروتونًا، يزيد عدد النيوترونات في نواة الكلور على عدد البروتونات. فالبروتونات يدفع بعضها بعضًا بشحنتها الكهربائية، وتساعد النيوترونات الزائدة القوة النووية القوية على إبقاء النواة متماسكة.
استُخدمت نوى الكلور-37 لكشف النيوترينوات القادمة من الشمس، وهي جسيمات تخترق أي مادة تقريبًا. وفي حالات نادرة جدًا، يحوّل نيوترينو يصطدم بنواة كلور-37 أحد نيوترونات النواة إلى بروتون. فتصبح النواة أرغون-37، وهو مشع، ويبلغ عمر النصف فيه 35 يومًا، أي المدة التي يستغرقها تحلل نصفه.
في ستينيات القرن العشرين، وضع ريموند ديفيس الابن في منجم ذهب في ولاية داكوتا الجنوبية الأمريكية خزانًا يحوي 615 طنًا مترّيًا من رباعي كلورو الإيثيلين، وهو سائل تنظيف شائع. وكان الخزان يحوي نحو 2 × 1030 ذرة من الكلور-37، أي 2 يتبعه 30 صفرًا. وبحلول عام 1994 كان ديفيس قد استخلص نحو 2,000 ذرة أرغون، وهو عدد أقل من المتوقع. وتقاسم ديفيس جائزة نوبل في الفيزياء لعام 2002 عن هذا العمل.