קליסטו הוא המרוחק ביותר מבין הירחים הגליליאניים. מסלולו הוא חיצוני לכל יתר הירחים הליליאנים, והוא נפגע על ידי מטאורים רבים יותר מהאחרים. כל הפגיעות הללו יוצרות מכתשים רבים מאד-מאד.